Diplômée du CNDC L’Esquisse, Cécile LOYER travaille avec Héla FATTOUMI, Eric LAMOUREUX, Catherine DIVERRES et Karine PONTIES.

En 2000, une bourse Villa Médicis Hors les murs lui offre l'opportunité de travailler à Tokyo avec Mitsuyo UESUGI (élève du maître Kazuo OHNO). Elle crée Blanc, son premier solo et reçoit pour cette pièce le premier prix au concours des jeunes créateurs de l’ESPACE Pier Paolo Pasolini de Valenciennes.

Cette création lui permet de poser les bases d’une recherche visant une écriture chorégraphique personnelle et singulière.
Celle-ci s’appuie sur la transmission et le travail de mémoire – les fondements du butô. Sans se réclamer du butô, la chorégraphe tente de confronter les techniques et l’inspiration de cet art à sa culture, ainsi qu’à sa pratique chorégraphique.

De 2000 à 2005, elle assiste Mitsuyo UESUGI lors de ses stages en Europe, en même temps qu’elle constitue en 2001, sa compagnie et crée Ombres, Détail, Raymond (au paradis), Pupi (un duo avec Mistuyo Uesugi), Rois, Fiasco + (avec Stéphane BROC, Vincent EPPLAY et Jean Baptiste BERNADET).

De 2004 à 2010, elle participe aux créations de Josef NADJ: Poussière de soleils (2004), Asobu (2006), Entracte (2008), Sho-bo-gen-zo (2009) et Cherry Brandy (2010).
En 2007, elle crée également, en collaboration avec Thomas LEBRUN, Que Tal ou comment vouloir peut être un problème, et son premier solo pour un homme, Blanc ou la mariée est un homme ce soir.
En 2009, elle crée Soldats et Morpho(s), en collaboration avec le musicien Eric BROCHARD (contrebassiste).

En 2011, la compagnie C.LOY/Cécile Loyer est accueillie en résidence annuelle au Centre Chorégraphique National d’Orléans / Josef Nadj .